Краснодарская региональная благотворительная общественная организация «Южный правозащитный центр» включена в реестр иностранных агентов на основании статьи 32 Федерального закона от 12.01.1996 № 7-ФЗ «О некоммерческих организациях». Решение о включении принято 27 декабря 2016 года.
Организация признана выполняющей функции иностранного агента, что влечет за собой особые требования к отчетности и маркировке материалов. Деятельность организации не запрещена, но подлежит контролю в соответствии с законодательством Российской Федерации.