Организация «Фактограф» включена в реестр иностранных агентов на основании статьи 6 Закона Российской Федерации от 27.12.1991 № 2124-1 «О средствах массовой информации». Решение о включении принято 05.12.2017. Деятельность организации признана соответствующей признакам иностранного агента, что влечет за собой установленные законодательством ограничения и обязанности.